В крови у рептилий и змей паразитируют простейшие родов Schellackia, Lankesterella, Haemogregarina, , Karyolysus, Plasmodium, Haemoproteus, Babesiosoma
Змеи являются основными хозяевами для этих паразитов, но для развития этих паразитарных организмов требуются промежуточные хозяева — москиты, клещи и пиявки.
Также в крови змей обнаруживают трипаносом (Trypanosoma inopinctum, T. diemyctyli и T. pipientis).
У рептилий обнаруживают также инфузорий типа Proteromonas spp., Trichomonas spp., Monocercomonas spp., Nycotherus spp. и Balantidium spp.
Кокцидиозы у амфибий и змей вызывают Isospora lieberku
У змей обнаружены и изучены представители семейств трематод, цепней, нематод (всего около 105 родов).
В пищеварительном тракте у рептилий и змей паразитируют нематоды Оphidascaris spp. -промежуточный хозяин амфибии; Physaloptera spp., Skrjabinoptera phyrnosome (промежуточные хозяева – муравьи). В печени змей различных подвидов часто обнаруживают Capillaria spp.
У рептилий, амфибий, змей обнаруживают цестод, хотя клинически цестодозы обычно проявляются редко.
У отдельных видов змей находили пентастомид: Armilifer urmillifer, Porocephalus spp. и Kiricephalus spp.
Арахнозы и энтомозы
На коже рептилий довольно часто можно обнаружить клещей вида Ophionyssus natricis, которые механически повреждают кожу змей, но эти клещи и являются промежуточными хозяевами многих кровепаразитов.
У рептилий и змей часто отмечают миазные поражения.
